Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGFO15240 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGFO15240 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGFO15240 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGFO15240 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms