Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP9YO00507 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP9YO00507 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP9YO00507 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP9YO00507 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP9YO00507 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP9YO00507 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP9YO00507 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP9YO00507 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP9YO00507 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP9YO00507 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms