Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms