Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C5orf49A4QMS7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms