Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP3Q9Y3E7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP3Q9Y3E7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms