Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms