Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC2Q9Y235 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms