Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHOC2Q9UQ13 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHOC2Q9UQ13 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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