Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNRF3Q9ULT6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms