Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB23Q9ULC3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms