Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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