Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPG2Q9UBF2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms