Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCMF1Q9P0J7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms