Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms