Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOR4AQ9NXH8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.3 ms