Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C1orf109Q9NX04 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms