Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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