Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BRD7Q9NPI1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms