Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE7BQ9NP56 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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