Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG4Q9H9E3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms