Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM55Q9BYV6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms