Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA7Q9BWT1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA7Q9BWT1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms