Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms