Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP53Q96M91 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP53Q96M91 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms