Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SAMD8Q96LT4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD8Q96LT4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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