Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERAC1Q96JX3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms