Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms