Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SMIM12Q96EX1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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