Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPACA9Q96E40 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPACA9Q96E40 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms