Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYTL4Q96C24 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms