Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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UBE2E3Q969T4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2E3Q969T4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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