Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL2Q969S2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL2Q969S2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms