Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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RABGGTAQ92696 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RABGGTAQ92696 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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RABGGTAQ92696 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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RABGGTAQ92696 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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