Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms