Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANKRD53Q8N9V6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD53Q8N9V6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms