Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNE4Q8N205 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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