Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLD3Q8IV08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms