Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP13Q86W25 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP13Q86W25 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms