Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM5Q71RC9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms