Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 30.6
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PRPF8Q6P2Q9 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 44.33□□□□□ -1.723e-8■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 GTF3C1-206ENST00000566779 645 ntTSL 38.72□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 GSPT1-205ENST00000562794 501 ntTSL 32.48□□□□□ -2.013e-7■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 28.97□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 NUP98-219ENST00000532475 553 ntTSL 47.57□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 POLN-213ENST00000515357 2183 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-14■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-14■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-14■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-14■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.431e-14■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 517.36■□□□□ 0.372e-18■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 511.15□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 30.5
PRPF8Q6P2Q9 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 56.3□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1177.3 ms