Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RWDD4Q6NW29 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RWDD4Q6NW29 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms