Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KRT80Q6KB66 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRT80Q6KB66 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms