Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms