Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALS2CLQ60I27 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms