Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BROXQ5VW32 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms