Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RIF1Q5UIP0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms