Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC38Q502W7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms