Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GTDC1Q4AE62 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTDC1Q4AE62 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms