Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GRIK5Q16478 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK5Q16478 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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