Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPTX1Q15818 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms